青年実業家の透野隆一は南米のマフィアから2人の美少女殺し屋を買い付ける。翠と藍と名付けられた彼女たちは透野の命令で、彼の妻子を殺した人間を狩ることに。だがその道行きで別の殺し屋女子たちと出会い、事態は思わぬ方向へ加速していくのだった…。
互いに引き寄せ合うように刃を重ね、銃弾を放ち合う翠、藍、伊万里、苺、蓮華、南天の6人の凶悪女子たち！翠と藍は主人である透野の妻子を毒殺した人物を捜すため、伊万里に接触する。伊万里は毒の扱いに長けた苺の存在を仄めかすが……。
翠と藍と名付けられた2人の美少女殺し屋。彼女たちは高校に通いながら、主人である透野の妻子を殺した人間を捜していた。その道行きで病んだ殺し屋・伊万里、893の娘・苺、その護衛・南天、蓮華と関わりを持つことに―――苺の配下で売春組織を仕切るせつな。彼女の秘めたる野望が迸る時、横浜の空は裏切りの血と硝煙で満たされていく……。
青年実業家の透野は南米のマフィアから2人の美少女殺し屋を買い付ける。翠と藍と名付けらた彼女たちは透野の命令で彼の妻子を殺した人間を狩ることに。翠たちは893の娘・苺から透野の妻子毒殺の実行犯は沙紀という殺し屋であると告げられる。一方、伊万里はその沙紀から命を狙われる同級生・葉子を護ることに――。
ある人物の衝撃的な死の直後、渋谷のど真ん中で衝突する凶悪女子たち。伊万里の同級生・葉子を巡る一件の決着は？暗躍を続ける沙紀、そして翠と藍を狙う新たなる刺客。さらに南天が苺のために、ある行動を開始する。伊万里たちの微妙な均衡がついに崩れる時がきた！？
主人を失っても復讐を続ける翠と藍の首に、遂に賞金がかけられた。二人への刺客を排除する沙紀を紅雪が襲い、更に伊万里がそれを妨害。任務を越えた思惑が、殺し屋たちの均衡を崩し始める。一方、手柄を求める蓮華は翠・藍に遺された金に目を付けるが、同じ狙いを持った何者かが横浜に現れた！
横浜で更に力を蓄えた苺たちや、賞金首の翠藍に手を出させたくない伊万里は、かわりに過剰な仕事を受けた結果、遂に後戻りのできない暴走を始める。身内の洲央に、つまりは飼い主・仙崎に牙をむいた伊万里へと、全方位から迫る刺客。その時、残る凶悪女子たちは…彼女たちの辿り着いた場所へ、衝撃の最終巻！巻末に『DESTRO246 ART WORKS』を特別収録！！
