2050年…近未来の日本。だが、日本代表はいまだワールドカップの優勝を成し遂げてはいなかった。なぜなら…世界最高の選手、天才と呼ばれる選手がいなかったから…札加市立札加第十一小学校に、ひとりのサッカー少年がいた。堂島兆――あどけなさの残る表情…だが、技術は本物だ。彼を世界最高の選手に仕立て上げることができれば…きっと…そのためには…天才は、創ることができるのか？これは、ひとりの少年を本物の天才へと成長させる物語である。
組織によって綿密に管理されたライバル、理解者、仲間達との出会いと別れ、そして16歳での日本代表への選出…それはすべて堂島兆という天才サッカー少年を作るための計画だった。そして、計画は第2段階へと移行する…高校生ながらプロ契約をした兆は、同級生の赤川ちかと夫婦生活を始める…これもすべて兆をより大人のプレーヤーとするために…だけど…新感覚天才育成ストーリー波瀾万丈の第2弾！！
類い希なる才能でファンを魅了し続けた堂島兆はクラブ世界一決定戦を境に姿を消し、宇宙空間にて特殊なトレーニングを受けていた。全ては母親に会うため…しかし、そのトレーニングの最中、「プロジェクト」の存在を知ってしまった兆は自身の存在意義に疑問を感じ始め、驚きの行動に出る……！新感覚天才育成ストーリー、驚天動地の最終第3弾！！
