“女の子だって甲子園”を夢見る主人公桐谷花鈴。 全日本高校女子野球選手権大会の抽選会の日、花鈴はまさかの寝坊で、焦って家を飛び出すが、行く先々でハプニングがあり…？！ 個性的なライバルたちを前に弱気になる花鈴だったが、埼女主将の朝陽さきに励まされ、公式戦の初勝利を誓う！ そして始まった抽選会では、連盟の理事からの衝撃的な報告が、花鈴たち女子野球部の心を揺さぶる…！ 女子野球の新たな道が拓かれる、待望の新章スタート！
晴天の中迎えた初戦の日。相手は青葉ゆい達4継を擁する『機動女子隊』の異名を持つ仙台杜の都高校。そんな2大会連続ベスト4の杜の都相手に公式戦未勝利の星桜高校はどう立ち向かうのか？胸を高鳴らせ花鈴は甲子園への一歩を踏み出す―！
試合中盤より降り始めた雨。中断された試合。ベンチで治療を受ける花鈴を見守るナインたち。このまま登板し続けるか、マウンドを降りるか花鈴の出した答えは・・・このピンチの状況を星桜ナインたちはどう切り抜けるのか―・・・？
