いくつものアルバイトをかけ持ちし、生活費を稼ぐ日々を送っていたアミリア＝エヴァンス。彼女の願いは、難病を抱えながら必死に勉学に励む弟のルークを名門校へ入学させてあげることだった。しかし、ルークの病状の悪化のため多額の治療費が必要となったアミリアは、金融業者に不審な契約を持ちかけられ、とある施設を訪れる。そこは、従来のパンドラとは違う新たな存在、「Ｅパンドラ」を生み出すための研究所だった──！Episode.19 姉と弟IEpisode.20 姉と弟IIEpisode.21 姉と弟IIIEpisode.22 姉と弟IV
人類の天敵「ノヴァ」に唯一対抗できる、「パンドラ」と呼ばれる若き乙女達。その歴史の中に、新たな可能性を引き出し、パンドラをさらなる次元へと引き上げた者が現れる。その名は「アオイ＝カズハ」、のちに「伝説のパンドラ」と称えられる少女だった――。ウェストゼネティックスを舞台に、編入生カズハやキム＝ユミ率いるナンバーズらの葛藤と戦いが描かれる、『フリージング』の過去と現在を繋ぐアナザーストーリー！Episode.01：アオイ＝カズハIEpisode.02：アオイ＝カズハIIEpisode.03：アオイ＝カズハIIIEpisode.04：アオイ＝カズハIVEpisode.05：アオイ＝カズハV
運送業を営む父のトラックに乗り、各地を旅するアーネット＝マックミルラン。彼女は父からゼネティックスへの入学を勧められるが、彼の元を離れたくない一心でその申し出を拒絶してしまう。一方、パンドラ候補生の訓練所に入ったエリザベス＝メイブリーは、鬼教官パク＝セミと出会う。理不尽な暴力を振るうパクの扱きによって心身ともに追い詰められるエリザベスだが、その誇り高き精神で試練に立ち向かっていく――！Episode.06：アーネット＝マックミルランIEpisode.07：アーネット＝マックミルランIIEpisode.08：エリザベス＝メイブリーIEpisode.09：エリザベス＝メイブリーIIEpisode.10：エリザベス＝メイブリーIII
ウェストゼネティックスに第28期生として入学した若きパンドラ達。上流階級の人間を目の敵にするアーネットは、出会って早々に資産家の娘であるアティアやエリザベスらに対して狂犬のごとく牙を剥く。その胸中では、パンドラ候補生の訓練所で起こったある悲劇が、深い闇となって渦巻いているのだった……。そしてボルトウェポンを扱い始めて間もないパンドラ達が、初めての実戦を体験する「春のカーニバル」が幕を開ける──！Episode.11：第28期ウェストゼネティックスIEpisode.12：第28期ウェストゼネティックスIIEpisode.13：第28期ウェストゼネティックスIIIEpisode.14：第28期ウェストゼネティックスIV
ウェストゼネティックスに入学して初めてのカーニバルに参加したアーネットは、目の敵にしていたエリザベスとついに対峙する。手段を選ばず苛烈な攻撃を繰り出すアーネットを、エリザベスのスティグマ・サテライト・システムが迎え撃つ──！一方、理想のパンドラを目指し努力を続けるイングリッドは、思うように成果を上げられず苦悩していた。そんな彼女に、リミッター漁りにかまけてたミヤビが意外な実力を見せつける！Episode.15：第28期ウェストゼネティックスVEpisode.16：第28期ウェストゼネティックスVIEpisode.17：努力と才能IEpisode.18：努力と才能II
イーストゼネティックスのパンドラであるキャシー＝ロックハートは、その飛び抜けた才能から周囲の期待を一心に集めていた。だが彼女自身はパンドラとしての人生に疑問を持ち、一人思い悩んでいた。そんなある日、問題児として注目されていたサテライザー＝エル＝ブリジットが騒動を起こし――!? さらに、ウェストゼネティックスの学園長・シスター＝マーガレットの若き日の秘話も明らかに！
「不世出の怪物」の異名を持つ最強のパンドラ、シフォン＝フェアチャイルド。レジェンドパンドラとして生み出されたシフォンは、何かを探し求めるかのように、ある日研究所を脱走してしまう。脱け出した先で生き倒れていたシフォンを救ってくれた少女、オーレルリ＝フェアチャイルドとの出会いによって、シフォンの心にも大きな変化が表れるのであった…。ついに明かされる、シフォン誕生の秘話！Episode.27 シフォン＝フェアチャイルドIEpisode.28 シフォン＝フェアチャイルドIIEpisode.29 シフォン＝フェアチャイルドIII Episode.30 シフォン＝フェアチャイルドIV
聖痕の移植によって、超人的な力を得た少女達「パンドラ」。 しかし移植者と聖痕との適合率を必要とするこの計画は、選ばれた女性のみしかパンドラになれず、その数もノヴァとの戦いによって減少するばかりであった…。 この事態に、アオイ＝源吾は新たな超人兵士計画を始動。 聖痕との適合率がなくとも超人的な力を得ることができる「ヴァルキリー」が誕生するのであった。Episode.31 ヴァルハラの戦士たちIEpisode.32 ヴァルハラの戦士たちIIEpisode.33 ヴァルハラの戦士たちIIIEpisode.34 ヴァルハラの戦士たちIV
チベットに暮らす「クンルン一族」の少女ラナ＝リンチェン。生まれながらに聖痕を宿す少女「タイプマリア」の存在を調査すべく、シュバリエより派遣された尾野雄太は、一族の次期長として称えられた少女、ルナ＝リンチェンと出会う。聖痕に身体を蝕まれていたルナを助けようとする尾野に少しずつ心惹かれて行くルナ。「クンルンの涙」受け継ぐ少女、ラナが背負った悲しき運命とは…。Episode.35 クンルンを継ぐ者IEpisode.36 クンルンを継ぐ者IIEpisode.37 クンルンを継ぐ者IIIEpisode.38 クンルンを継ぐ者IV
