超問題児である桜竜次と花咲青児が修学旅行に参加。もちろん、ただで済むわけはないのだが、なんと学生同士のケンカではなく、拳銃を奪って刑務所を脱走した殺し屋に遭遇。しかし、その殺し屋が罪を重ねるのには理由があった。
揉め事の連続で、近所の中学で知らない不良がいないほど有名になったあばれ花組の花咲青児と桜竜次。そんな花組に贋者が現れ、悪行の限りを尽くし始める。さらに、関西から放たれた刺客も登場し……。
教師という立場を利用して、甘い汁を吸い放題だった箱崎が何者かに襲われた。血まみれの箱崎の写真を貼りだした犯人は、自らを天誅組と名乗る。天誅組の制裁は徐々にエスカレートし、ついには罪のない生徒にまで天誅が及ぶ。そしてついに、竜次の身にも天誅が……。卑劣な天誅組に対して立ち上がる花組。
轟の姉が結婚してラーメン屋を開店することに。お祝いに駆けつける合唱部の面々に紛れ込んだ花組の花咲青児と桜竜次。そこに、轟の姉夫婦と因縁のあるムショ帰りの男が現れ……。
女の子大好きの青児と違い、硬派一本の竜次に疑惑が……。真相究明に乗り出した花組の前に次々と現れる恐るべき新事実。テニス部顧問の島崎の毒牙にかかる女の子を救え！
花組の宿敵であり、良き先輩であり、理解者であった轟が、4年間の中学生活を終え、ついに卒業。感動と涙の卒業式……、になるわけもなく、お礼参り計画も絡んで結局大乱闘！ 青児と轟の最後のケンカの結果は!?
転校早々剃刀を振り回す危険な赤毛の転校生、安西。安西の正体が女だということに気付いた竜次は、安西が横浜走乱族に追われていることを突き止める。女相手に卑劣な罠を仕掛ける横浜走乱族に花組の怒りが爆発!! 全面抗争に発展する。たったふたりで横浜走乱族に立ち向かう花組。勝ち目はあるのか!?
悪徳警官の罠にはまった花咲青児と桜竜次の花組ふたり。巧妙な警官の策略の裏には、仲間であるはずの蟹沢の裏切りがあった。友を信じたい気持ちと悪徳警官への怒りの狭間で、葛藤するふたり。そして、花組の優しさに触れた時、蟹沢がとった行動とは？
あばれ放題、遊び放題の学園生活を送ってきた花組のふたり、花咲青児と桜竜次のふたりもついに中学3年生。同級生には、受験のプレッシャーから、悪の道に踏み込む人間も……。ひょんなことからそんな人間のひとりである優等生の、吉田真弓と出会ってしまった竜次と青児。竜次は真弓に声をかけるが……。
ケンカに恋に明け暮れた池名井中学での3年間が終わりに近づいてくる花咲青児と桜竜次。少しは殊勝になるかと思えば、相変わらずのあばれ放題の花組ふたり組。そしてなぜか、卒業式の答辞がこのふたりに回ってきた!?
