ニヴラスの刺客“蝶のパフィオ”の張った罠におちたマズル達を救ったのは第三の竜騎士、ダク＝テイルズだった！千年帝国歴1250年、北方の大国、ニヴラス帝国が世界制覇に乗り出した。これは、大空を自在に駆けめぐる飛竜にまたがり、ニヴラス帝国に挑戦する戦士達の物語である。空に憧れる盗賊の少年ゼファは、偶然にも滅びたはずの竜騎士（ドラゴンナイト）と出会った！帝国打倒を目指す竜騎士達とゼファは、共に旅することとなる。そして、ニヴラス帝国の攻撃は彼らに容赦なく降り注ぐのであったが……。
新しく仲間を迎え、意気揚々とアジトに戻った竜騎士団だったが、そこに届いたのは、ギート王国にニヴラス軍が攻め込んだという知らせであった。度重なる戦の中で王が戦死したギート王国では11歳の王子ハードレッドが国王に即位しようとしていた。混乱する民衆達を何とか奮い立たせる騎士団長のウルフノートであったが、ニヴラス軍の奇襲に遭い絶体絶命の危機に……。しかし、そこでマズル達がついに立ち上がった!?
