平次に誘われ大阪へ。のんびり食い倒れを楽しむはずが、殺人事件に巻き込まれ、大阪の街を西へ東へ大移動！！こんな形で観光することになったけど、平次のルーツをしっかり見たぞ！！
コンサート会場でカンケリ遊び！？そこでTWO－MIXの高山みなみちゃんと遭遇だ！ところがここから事件発生！みなみちゃんが誰かにさらわれた！！またもや少年探偵団にかり出されちまった…。でも、彼女の声、誰かに似てる…！？
今回の事件は本当に参った…。みんなは待ってたかもしれないが、オレにとっちゃ実に厄介な相手だったぜ…。とにかく、怪盗VS名探偵の大勝負、じっくり楽しんでもらおうか！！
真夏の海で何かが起こる！？いろんな人のいろんな思惑が絡み合い、灼熱の太陽が照りつけるなか、誰かの身に危険が迫る…。真実を海の中に逃がさぬように、コナンが殺意をあぶりだす！！
奇妙な転校生がやってきた…。なんとオレの正体が新一だって知ってるぞ！一体こいつは何者なんだ！？同時にニセ札事件も発生だ！敵か味方か、見当もつかない謎の少女…奴の本当の名前は何！？
少年探偵団のみんなと国立競技場でサッカー観戦をするコナン。ところが、拳銃を所持した凶悪犯が、テレビ中継中の日売テレビに観客の身代金を要求する事件が発生した！コナンは現場に駆け付けた目暮警部と共に、観客席を映すモニターの中から犯人を捜し出そうとする。試合終了まで残り数分。犯人は、どこだ！？
ある日、キャンプに出掛けたコナンたちは、道に迷い怪しげな孤城へと到着する。そこでコナンは隠し扉を発見したのだが、その瞬間背後から何者かに襲われる。コナンを捜して大騒ぎする少年探偵団の仲間たち。この城には財宝がたくさん隠されているというのだが…。コナンの行方は！
結婚式前夜の森園邸に招かれたコナン達は、そこで思わぬ殺人事件に遭遇した。殺されたのは森園家の執事・重松。現場の状況を調べた平次とコナンは、事件が密室殺人であることに気付く。しばらくして目暮警部が到着し、警察による現場検証が始まる。その様子を見ていた平次とコナンは、互いに、事件を解くためのキーワードが4つあると確認しあう。ところが、その時…
阿笠博士にもらった割引券で、映画を観に来たコナンたち少年探偵団。子供のころにさんざん観た怪獣映画に、コナンはいささか退屈ぎみ。休憩時間に売店に立ち寄ったコナンたちは、その映画館が今日の上映終了後、閉館する予定にあることを知る。その背後には、映画館の跡地を高く売ろうとする不動産屋・張田が絡んでおり、彼の度々の嫌がらせのため、客足もすっかり遠のいていたらしい。2本目の映画を観るコナンたち。ところが途中、スクリーンに黒い影が写り、映画は中断される。照明を取り戻した館内でコナンたちが見たものは……
元太、哀、歩美たちと学芸会の練習をしていたコナンは、脱走犯とそれを追いかける佐藤・高木刑事と出会う。佐藤刑事は追跡の末、古いビルの一室で犯人を捕獲するが、脱走犯は無実を主張。身動きがとれなくなった佐藤刑事に代わり、高木刑事とコナンたちは真犯人捜しを始めるが……。
