今大会注目のスラッガー・赤井を擁する健丈高校を、一年生バッテリー立花兄弟の活躍により撃破した明青学園！世間の注目も日に日に増していく彼らの、快進撃はいつまで続く…！？意外な事実なども発覚しつつ…夏、深まります。
父の死を乗り越え、明青バッテリー再始動！父・英介の死を乗り越えて、秋季大会に臨む投馬と走一郎。春の甲子園出場に向け死角はないはずだが、まさかのアクシデントが…？
投馬不在の秋季大会で、明青ナインが奮起！ケガをした投馬を来春の甲子園に連れて行こうと、全員野球で秋季東京都大会を戦う明青学園野球部。走一郎をマウンドへ送り勝利を狙うが、果たして？一方、投馬のケガに疑問を抱いた音美は、その真相に迫りつつあり…
秋季大会大詰め。皆で投馬を春の甲子園へ。右手を負傷した投馬を来春のセンバツ甲子園に連れて行くため、団結する明青学園ナイン。秋季東京都大会は、いよいよ準々決勝へ――
秋季東京都大会、決着。センバツの行方は？秋季東京都大会、準決勝。負傷した投馬を春のセンバツ甲子園に連れて行こうと、奮闘する明青学園ナイン。終盤までもつれた試合が、ついに決着！
