新章「水文明編」突入！水文明のデュエルマスター「キャップ」と友達になったジョーは新たな能力「GR」の力を得る。闇文明の宿敵、ゼーロともついに激突！！
ジョーVSゼーロ！最終決戦！零龍を倒せ！デュエル・マスターズ超天篇の最終決戦！！ついにゼーロの最凶クリーチャーである零龍が卍誕した！零龍の卍誕を阻止しようと向かったジョーの親友キラ。しかし、その正義も虚しく零龍は卍誕してしまい、キラは無にされてしまう。ジョーが向かった先には消えゆく友の姿が・・・！ジョーはキラを救うことは出来るのか？！そして零龍を倒すことはできるのだろうか・・・？！
