一瞬で銀行強盗を撃破した、一見普通のサラリーマン田中勤。梁山泊を訪れた田中勤の口から明かされる、衝撃の事実とは！？そして徐々に明らかになる、“久遠の落日”という言葉の持つ意味…動き出した“闇”との抗争はますます激化！敵陣潜入！全面戦争！！
闇vs梁山泊の全面戦争が火蓋を切られた状況下、学校から帰宅する兼一と美羽のもとにも、YOMI入りを狙う武術家たちが襲いかかってきた。彼らを倒し事情を聞くと「いま、武術界では誰もが最強の弟子を捜している」と言われ、どうやら闇が兼一の情報を武術界に流していることも分かってきた。想像以上の深刻な事態に、美羽は兼一を24時間サポートすることを約束するが…
スキー林間学校でYOMIの一人を倒した兼一は、日常に戻り、梁山泊で師匠たちの訓練を受けていた。するとそこに居合わせた兼一の妹・ほのかが突然「こん中で誰が一番強いの？」と言いだして道場は異様な空気に。結局バトルは回避されたが、そんな中、下校中の兼一に元ラグナレクの辻が決闘を申し込んできて…
若き武術家たちが競う、裏の大武術大会“DオブD”が行われる孤島へ向かうことになった兼一と梁山泊の面々。だが、そこに新白連合の仲間たちが現れ、彼らも大会への出場を志願する。結局、長老は彼らを船に乗せずに出発してしまうが、そこに現れたハーミットの自家用船で兼一らを追うことに…
“DオブD”一回戦に勝利した新白連合が気勢を上げる中、戦いの雰囲気に怯えて逃げ出してしまった兼一。それを察した長老は「優勝したら美羽と付き合ってもいい」と耳元でささやき、兼一はがぜん勇気を取り戻す！だが、観客席に戻った兼一が目にした次の登場選手は、どうみても長老がマスクをかぶった「謎の青年・我流X」で…！？
“DオブD”一回戦。からくも勝利した兼一が意識を失っている間も、他の試合は着々と進行していた。1対5で一撃もくらわず圧勝したカポエイラチーム、残酷な攻撃をにこやかに決めたブフ（モンゴル相撲）チーム、指一本で敵を倒したサラリーマン風選手などの強烈な試合の模様を、試合後に新島から聞いた兼一は…？
“DオブD”2日目。優勝候補の一角・古代パンクラチオンチームの試合を前に会場が盛り上がる中、門前では見張りの兵を倒して侵入しようとする1人の男が…。その正体は、デスパー島上陸時に爆死したと思われていたハーミット！さらに衛兵との戦いの最中、やはり行方不明となっていたハーミットの師匠・馬槍月も姿を現して…！？
S・F・I（死んだふりして生きかえる）作戦で、カポエイラチームのひとりを場外負けに沈めた新白連合チーム。だが、この作戦の代償で宇喜田は大ダメージを負い、リーダー新島はもともと戦力外のため、現在まともに戦っているのはキサラひとり。修業先のチベットから急きょ参戦し、新島が期待を寄せていたジークフリートは、なぜかやられっ放しで…！？
梁山泊とFBIによる「デスパー島包囲作戦」が開始された。ゲートは次々と爆破され、会場にいた観客は全員避難。そして突撃の指揮を取るFBIのジェニーと逆鬼はコロシアムの中へ向かった。一方コロシアムでは、兼一との対戦権をめぐって叶vsジェミニチーム、YOMI同士の対決が始まろうとしていたが…！？
叶の猛攻を受けて倒されかけた兼一。だが、そのとき兼一の体にかつてない変化が現れた！一見、全く闘争心がないような表情を浮かべつつ、制空圏を薄皮一枚まで絞り込み、最小限の動きで敵の攻撃をかわす…。それは、かつて闇ヶ谷の修行で長老から伝授された、静の極みの技のひとつ“流水制空圏”だった。しかし、叶はその技にも動じないばかりか、笑い飛ばす余裕を見せて…
打倒梁山泊を掲げる闇の一影九拳。その弟子集団“YOMI”の新リーダーは、一影の弟子・鍛冶摩里巳に。そしてDオブD終結後、高校2年生に進級した兼一と美羽だったが、新学期初日、なんとYOMIのメンバー4人が兼一たちの通う荒涼高校に海外留学生としてやってきた。果たして彼らの目的とは…！？
