世界中の偉人のクローンのみが通うセントクレイオ学園において、唯一の非クローンである神矢史良。その学園の一大行事である「学術研究発表会」が、謎のテロリスト達によって襲撃された。テロリスト達の正体は…なんと学園の卒業生、つまり偉人のクローンだった。さらに、その中には史良と良く似た顔を持つ男が3人！？史良に似た男の一人によって磔にされたジャンヌ・ダルク…その運命は？史良は、ナポレオンはジャンヌを救うことが出来るのか！？謎が謎を呼ぶ、新感覚学園ファンタジー！！
幼い頃に出会った前世代のクローン・ナイチンゲールに憎しみを抱き続けている双子の兄弟。母を見殺しにされたその恨みを晴らすため、武器を携え学園へ侵入するものの失敗、二人は離ればなれに。一人残された弟は、世間に姿を現した現在のナイチンゲールの誘拐を企てる。しかしこの一件は、偉人クローン全ての運命を破綻へと導くきっかけであった…。新感覚ファンタジー、クライマックス直前の第11集！
クローン保護法が成立し、窮地に立たされた史良達。ヒトラーへの最後の説得も空しく、セントクレイオ学園に権力の介入を許す事態となる。しかし、部隊を率いて学園内を蹂躙するアインシュタインは、無抵抗の生徒達に銃口を向け…！？はたして、偉人クローン達の運命は…！！？世界の偉人のクローン達をめぐる新感覚ファンタジー、堂々の完結！
