史良に酷似した男＝カイとともに学園を脱出したエリザベスとヒトラー。一方、父親の神矢からあらためて自身がクローンであることを告げられた史良は、学園を「卒業」して、クローン・レオナルド・ダ・ヴィンチが統べる財団へ身を寄せることに。そこで史良は、ある懐かしい人物と奇跡の邂逅を果たす。そして財団にいる間、己の「オリジナル」の意思を継ぐことを求められる史良…。そんな中、アインシュタインら前世代クローンと合流したヒトラーが、メディアを通じて衝撃的な告白を…！？
幼い頃に出会った前世代のクローン・ナイチンゲールに憎しみを抱き続けている双子の兄弟。母を見殺しにされたその恨みを晴らすため、武器を携え学園へ侵入するものの失敗、二人は離ればなれに。一人残された弟は、世間に姿を現した現在のナイチンゲールの誘拐を企てる。しかしこの一件は、偉人クローン全ての運命を破綻へと導くきっかけであった…。新感覚ファンタジー、クライマックス直前の第11集！
クローン保護法が成立し、窮地に立たされた史良達。ヒトラーへの最後の説得も空しく、セントクレイオ学園に権力の介入を許す事態となる。しかし、部隊を率いて学園内を蹂躙するアインシュタインは、無抵抗の生徒達に銃口を向け…！？はたして、偉人クローン達の運命は…！！？世界の偉人のクローン達をめぐる新感覚ファンタジー、堂々の完結！
