学校の管理教育を変えようと、ハルたちは生徒に呼びかけて生徒総会を開く。しかし、内申書でおどす教師たちのせいで、30人ほどしか集まらなかった。そして、ハルたちをこころよく思わない生徒たちによって、暴力沙汰が起きてしまい……！？
日本のテレビマンの協力を得て、ビルカバンバの山中に出発したハルたち。しかし、番組の放映日を気にする麻見とハルは意見の食い違いで険悪な状態に。そして、山中で仮面をつけたガルシアたちの襲撃にあい、かんなは腕を負傷して高熱がでてしまう。
ビトコスの映像をどうしてもカメラにおさめたい麻見は、ビトコスをさがしにひとりで出て行ってしまう。ハルたちはジャングルの中を必死でさがすが見つからない。そして、ガルシアたちに見つかり監禁された麻見は、金品でインディオたちを操ろうとして……！？
真っ暗な地下水道を下っていたハルたちは、急流にのまれ、ハルだけひとり離れ離れになってしまう。助かったかんなたちはビトコスで麻見と再会する。その夜、麻見はインディオたちに行くのを止められていた石の塔に登ってしまい……！？
麻見は黄金の魅力に目がくらみ、ガルシアたちと対立して戦いがはじまってしまう。否応なしに戦いを強いられるハルたち。黄金の在りか知ってしまったハルはガルシアと話がしたいと申し出る。そして、ガルシアはハルとかんなをエル・ドラドに連れて行く。
エル・ドラドの崩壊によってハルたちは助かった。そして、クスコの街へ戻り、ケガをしたロッキーとソフィアはイタリアに戻ることに。ペルーに残ることに決めたハルとかんなは神秘の空中都市マチュ・ピチュへ向かう。日本から遠く離れた地で、ハルが求めていたものは見つかるのか！？
