海辺の民宿に泊まったチワ丸一行。だが、ここは怪談話に出てくる“墓前宿”と呼ばれる宿だった。深夜決まった時間になるとまりをつく音が聞こえ、さらに少女の霊から電話がかかってくるという。その話を聞いて眠れずにいたみどりとチワ丸は、大坊主とハンサムの寝顔に落書きすることで時間を潰していたが…？
地球に恐竜が誕生する、そのさらに前…お坊さんがめっちゃ元気な時代があった！世界一のお坊さん・大坊主に弟子入りした不敵な小坊主・チワ丸くんが気張ります！今、最も光っているありがた迷惑GAG！！
「化」の大数珠を狙う坊主四天王のひとり・乙姫に襲われたチワ丸一行。チワ丸も仲間たちも縛り上げられるが、秘かに隠れていたエリートが「速」の数珠の力で、素早く救出してくれた。友人の結婚式で頼まれたものまね芸の約束が果たせないことを嘆いた乙姫が暴れ出したため、竜宮寺が崩壊し始めて…？
九つ目の大数珠「霊」は、死んだ祖父に代わり美術館の館長を務めている少女の元にあった。この大数珠によって毎日祖父と交信することが唯一の生きがいだという少女から、取り戻すためにチワ丸たちが取った行動は……泥棒。厳重な警備体制が敷かれた夜の美術館へ侵入を試みた面々だが…？
突如現れた偽チワ丸一行と、本物を決める戦い中のチワ丸一行。早速イヌが敗れる波瀾の後は、謎の審判・紫とグルになったみどりの勝ち、興奮して血管が切れた大坊主の負け、試合内容は省略されたがハンサムの勝ちと、2勝2敗のイーブンに。そして迎えたチワ丸対偽チワ丸の最終対決、勝って本物に認定されるのはどっちだ…？
大数珠探しの旅のはずが、なぜか未確認生物“手足のついた大蛇”探しを始めたチワ丸一行。さっそく大きな足跡を発見してたどっていくが、いきなり転がってくる丸太や、濁流にかかるボロいつり橋に行く手を阻まれ大苦戦。果たして大蛇を生け捕りに出来るのか…！？
みどりがお正月の挨拶にいくと、大坊主寺ではちょうど餅つきの真っ最中。餅をこねる役をなぜかチーターがやっていて、毛が入るという懸念もあったが、美味しそうなつきたて餅が完成。みんなで味わっていると、大坊主が「すすり餅」に挑戦するなどと言い出して…？
自分の事務所の新人アイドルがライブをするからと、チワ丸からアキバ村に呼び出された大坊主たち。だが、そのアイドルとはなんと金玉子だった。Mステ出演という意外にちゃんとした夢を持つも、唄はやっぱり下ネタ。だが地道な努力が報われ、本当にMステに出演できることになり…？
