「キミとアイドルプリキュア♪」が、“宇宙１”のアイドルフェスティバルに出演！不思議な島に隠された秘密とは…？ある日、珊瑚の妖精・トットに招かれたうたたちは、アイアイ島と呼ばれる不思議な島で開催される、［スーパーミラクルアイドルフェスティバル］に出演することに！とっても大きな会場には、ロボットや動物など、いろんなアイドルがい～っぱい大集合♪宇宙１のアイドルフェス開演！のはずが…？突然、謎の怪物があらわれて、アイアイ島と世界がピンチに巻き込まれちゃった…。しかも大変！過去に飛んじゃった～！？ピンチを救うヒントは、島の女神の伝説と、島で出会ったアイドル嫌いの謎の少女・テラに隠されていて…？そして！アイアイ島に、「わんだふるぷりきゅあ！」と「ひろがるスカイ！プリキュア」も駆けつけるよ！さぁ！歌って踊ってファンサして、キミに届けるキラッキライブスタート☆
ナノサイズになる人体探査機・ヒポクラテス号に乗り込んだジオとノウ博士。ところが、小さくなった”ヒポ号”をピピがうっかりのみ込んだ...！？巨大な歯につぶされそうになりながら猛スピードでピピの体の中に流れ込んだ２人。胃から腸へと向かって脱出するつもりがトラブル続きで脱出不可能、絶体絶命の大ピンチ！！そして、突然苦しみ出すピピの身に一体何が...！？ピピとの約束をはたすため、ジオは決死の行動に出る。「必ずピピを救って、サバイバルしてみせる！」
