春野はるかは『ノーブル学園』に通う中学１年生。夢は「プリンセスになること」！！大好きな絵本に出てくるプリンセス…そんなステキな人に絶対なりたいと願うはるかは、昔『カナタ』という不思議な少年と出会い、プリンセスになる夢をあきらめないと約束したのです。新しい生活をはじめるべく学園の寮に入ったはるか。寮の裏庭でパフとアロマという妖精と出会うのですが、そこに、人々の夢を「扉」の中に閉ざし絶望に染めてしまうディスダークの幹部・クローズが目の前に現れて……！！『プリンセスパフューム』と、『カナタ』にもらいお守りにしていた『ドレスアップキー』で、『プリンセスプリキュア』に変身したはるかは、絶望の怪物ゼツボーグを撃退。そして、「つよさ・やさしさ・美しさ」をかねそなえた真のプリンセスを目指して、仲間たちと共に人々の夢を守るため、絶望の帝国ディスダークに立ち向かっていくのです。
【パンプキン王国のたからもの】おとぎの国のようなパンプキン王国。この国のプリンセスがお城に閉じ込められているのがわかります。いったい、誰が何のために？プリンセスを助け出し、パンプキン王国の未来を取り戻さなければ！ 【プリキュアとレフィのワンダーナイト】夜の闇に閉ざされた国、パンプキンキングダムで、昼を取り戻すためのカギを握るのはミラクルプリンセスライト！みんな力を合わせて、パンプキンキングダムに光を取り戻しましょう！ 【フローラといたずらかがみ】すてきな髪飾りを手にウキウキしていたキュアフローラですが、髪飾りをつけてカーテンを開け、クシャミをした瞬間、鏡の中のキュアフローラはおすまし顔！？キュアフローラと鏡の中のキュアフローラの不思議な鏡の物語が繰り広げられます！
ある日、宇佐美いちかはフシギな夢で見たサクラという謎の女の子と、現実の世界で出会ってしまった！「桜が原」という別の世界からやってきたサクラは、＜世界中のキレイなもの＞を狙う鴉天狗の魔の手により離ればなれとなった友達の狐・シズクを助ける為に、「鍵」「宝石」「スイーツ」のプリキュアを探しているのだという。やがて、『ＧＯ！プリンセスプリキュア』『魔法つかいプリキュア！』『キラキラ☆プリキュアアラモード』と大集合したプリキュア１２人の前に、鴉天狗の手下・赤狗黄狗、そして謎の強敵・五月雨が立ちはだかる。すさまじい妖力により追い詰められるも、何とかピンチを切り抜ける。そして、サクラの想いに導かれるように、桜が原へと続くトビラの封印が解かれた。大切な友達・シズクを助けるため、プリキュア１２人はいざサクラの世界へ―――。トビラを抜けたその先には、キラキラ輝くキレイでフシギな世界が広がっていた！
