地底で眠っていたイザール星人が、人類に対する侵略を開始した。それに立ち向かうべく花月博士は、移動要塞のゴッドフリーダムとマグネロボガ・キーンを作り上げる。
研究所を飛び出した猛であったが、マイティーが合成獣と苦戦しているのを知りゴッドフリーダムに戻った。合成獣タコガニーを破ることが出来るのか?ガ・キーン!!
武道家日本一を目指す北条猛は戦うとき以外心を一つにすることが出来ず、チームワークを乱したり、勝手な行動をとってしまう。
ガ・キーンの足首を弱点とみた総司令ブレーンは合成獣ロドレフに足首を攻撃させてきた。絶対絶命か?猛は大車輪アタックで反撃にでる!!
独の出た孤児院を盾にして、怪電波を発信、ガ・キーンの合体を妨害するイザール星人たち。独はチームワークを第一に考え、そして皆を信じ、合成獣たちに立ち向かう。
マイナスマグネマンの誘拐を企てるイザール星人たち。寸前に猛が阻止するも、地の底からとてつもない合成獣ツチノゴンが現れる。
ゴッドフリーダムがイザール星人に乗っ取られ、時限爆弾をしかけられた。研究所とガキーン無き地球にイザール星人は合成獣ブルドッガーを送り、絶体絶命のピンチにまで追い込む。
空手試合の決勝戦で、タケルは敗れてしまった。それは技では無く心で負けていたのだ。すなわち相手の心を掴む心の技が足りないからであった。そんなある日、姿が見えなくなる合成獣が現れた
ゴッドフリーダムにフトシの妹、カオリちゃんがやってきた。そのカオリちゃんがイザール星人にさらわれてしまった!がんばれフトシ妹を救うのだ!!
南極基地近海に異常放射能現象が現れ、デリバリー号は原因を突き止めるため気象条件の厳しい南極へ出動した。そこへ合成獣ガメガマが現れ、絶対絶命のピンチに第11話
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