１９９９年１月某日、警備会社エステックに一本の電話が入った――。社長の大崎（筧 利夫）は、学生時代の先輩で寺の住職・小泉（芦川 誠）からの依頼を受け、精鋭チーム・第二警備隊を結成する。政治団体を標榜しつつもその実は指定暴力団・真政会の一味である護国大憂党は、寺の利権を狙って日々執拗な嫌がらせを繰り返してくる。大崎指揮のもと、隊長・高城（出合正幸）と中本（野村宏伸）を中心に、紅一点の佐野（竹島由夏）も加わり、大恩寺の警備警護にあたる隊員たちであったが、９月９日夜、ついに中本が凶弾に倒れてしまう・・・。
除霊師見習いの雫音（志田友美）は、師匠の美代（竹内えり）と修行の旅に出ていた。ある日、ふざけて廃校に忍び込んだロックバンドメンバーのミカ（多田愛佳）やジョー（淳士）らが肝試しをしていたところ、一緒に参加していたや友人の亜紀（横山ルリカ）が命を落としてしまう。事態に怖じ気付きお祓いにやって来た彼らの話から邪悪な霊の存在を感じ取った雫音は除霊のために廃校へと向かうーー。
「つちのこ」、「モッシー」、「雪男」にスポットライトを当て、それぞれの姿を捉えた可能性がある映像を元に調査を開始したが、事態は驚愕の報告へと発展していく！
那須塩原市を流れる川で、SUPのアウトドアガイドをしている君島賢司は、父を幼い頃に川の事故で亡くし、母と二人で生きてきた。その母を病気で亡くして、一人きりになる。母が生前言い残した「自由に生きなさい」という言葉、7年間世界を旅してきた女性との出会いを経て、自分の生き方は、ただ流されているだけなのだろうかと疑問を持つ。しかし地元の人と自然に癒され、再び自分らしい生き方を見つめ直していく。
午前３時に結界が崩壊する！ 映画部に所属している、倉田さくらたち５人は、映画祭に出品するため、深夜の学校で“ひとりかくれんぼ”を題材に、「ヤラセ」のホラー映像を撮影する事になった。学校の各所に定点カメラを設置し、あくまでもフィクションとして撮影を進めて行くが、“ひとりかくれんぼ”本来の人形を用意し、腹部を切り裂き、米と爪をその中にいれ、赤い糸で縫い合わせ、人形に自分以外の名前をつけるというルールに従い進行していった。
