子どもの頃、将来を嘱望される馬術選手として注目を集めていたデビィ。だが経済的な事情から競技を続けることができず、現在は牧場で厩舎の掃除や馬の世話をしながら、調教師として働いていた。ある日、牧場に馬を買い求めにきた一家の前で馬に乗ったところ、その技術に目を留めた乗馬トレーナーのジョナサンから、再び馬に乗ることを勧められる。そのために馬を買いたいと考え実家に頼むが、費用を用意できるはずもなかった。そんな折、馬の競売会で暴れ馬に出会ったデビィは運命を感じ「乗りこなせたら安く譲ってほしい」と持ち主に直談判。見事に馬を乗りこなした彼女は、その馬を手に入れることに成功する。その馬に“伝道師”の意味を込めてエバンジェリストと名付け、再び競技の世界へと挑戦を始めるのだが…。
アメリカ独立記念日の7月4日。突然、地底、そして空から未知の物体が大群で地球に現れ、人類に攻撃を仕掛けてきた。世界各地が猛火に包まれ人々が大パニックに陥る中、田舎町の消防士で大統領サム・ガーネットの弟でもあるピート・ガーセットは地球外生命体研究組織S.E.T.Iのセリアと遭遇し、ディクソン空軍基地へと赴く。大統領の息子アンドリューと友人ニック、物理の天才高校生イライザも同じく基地を目指し、ピートらと合流する。一方、大統領はエアフォース1が撃墜されたものの奇跡的に生き延び、オタクハッカーのトッドとレニに出会う。しかし、そのことを知らない副大統領は代わって指揮を執り、エイリアンに向けて猛攻を開始するのだが…。
致死率100％の新型インフルエンザが発生。世界中の死者は30億人を超え、WHOは人類滅亡の危機だと警告。アメリカでは、サバイバル・テクノロジーズ社が開発した地下バンカーが建設され、当選者50万人を避難させた。入居者は個別に隔離され、情報と交流のための7人組プラットフォーム“ドメイン”で、他者とのコミュニケーションを図る。そんな仮想共同体生活から5年の月日が過ぎた頃、フェニックスたちのバンカーで、自らを“人殺し”と称して悪びれるオーランドが多数決で追放された。その8ヵ月後、システム端末に不具合が生じ、フェニックスは回復のためにオーランドと再接続することを提案するが、既に部屋から彼の姿は消えていて…。
