とある地方都市を訪れていた伸山賢兵は、この地を根城とする夜叉一族の娘・あずさと知り合う。実は伸山の正体は、日本政府の秘密警察「特捜密殺員」から、夜叉一族と争っている“殺しの軍団”の異名を持つ武闘派ヤクザ・岩城勇吾率いる岩城組の殲滅を依頼されたフリーの殺し屋であった。
日本政府が極秘で組織した秘密警察「特捜密殺員」を率いるチーフ・神岡将士は、戦力拡大のためにフリーの殺し屋・伸山賢兵に目をつけた。神岡からの勧誘を頑なに拒む伸山であったが、そんな中、謎の女暗殺者の襲撃を受ける。その危機を救った志水舞瑠は「夜叉組」の仕業と推測するが…。
“鬼刑事部長”と恐れられる警視庁組織犯罪対策第四課の飛鷹遼司は、その強引な捜査のやり方から警視庁内部で異端視され、新人刑事・市瀬桃香の指導係を命じられてしまう。そんな中、“狂犬”の異名を持つ武闘派ヤクザ、獅子王会鴉間組幹部・西敏彰が15年の刑期を終え、出所してきた…。