新宿歌舞伎町警察署捜査課の女刑事・北条綾香は、パトロール中にヤクザ相手に銃を撃ち合っていた舘川竜士を現行犯逮捕するが、舘川は闇社会を司る謎の黒幕（フィクサー）『龍帝』から絶大な信頼を受ける“歌舞伎町の顔役”と名高いアウトローであり、即釈放されてしまう。納得がいかない綾香は舘川逮捕のため自ら行動を起こすが…。
日本政府が極秘で組織した秘密警察「特捜密殺員」を率いるチーフ・神岡将士は、戦力拡大のためにフリーの殺し屋・伸山賢兵に目をつけた。神岡からの勧誘を頑なに拒む伸山であったが、そんな中、謎の女暗殺者の襲撃を受ける。その危機を救った志水舞瑠は「夜叉組」の仕業と推測するが…。
ICPO（国際刑事警察機構）から日本侵攻を企む国際犯罪組織の首領（ドン）『闇龍帝』を追って来日した若き捜査官・王龍輝は、戦後の動乱期より代々闇社会を司る謎の黒幕（フィクサー）『龍帝』から絶大な信頼を受ける“歌舞伎町の顔役”舘川竜士と知り合うが…。
