SPY×FAMILY Season 3　全話

「バーリント・パニック」休日に公園を訪れたフォージャー家。ご機嫌でアイスを頬張るアーニャだったが、ボンドの未来予知から工事現場で事件が起こることを読み取り大慌て。なんとかロイドたちを現場へ連れていくと、作業員が重機を操り暴走しはじめて……。／「情報屋と〈夜帳（とばり）〉」フィオナは〈WISE（ワイズ）〉の任務を受け、印章偽造のプロを探すためにフランキーを頼ることに。約束したクラブで偽造屋と会った２人だったが、交渉は難航。そこへ保安局が現れて……。

「〈雷（トニト）〉を回避せよ」イーデン校にトニトおばさんことシュラーク先生が現れた。風紀に厳しいシュラークは、アーニャのクラスでも持ち物検査を実施することに。ハンカチを忘れて慌てるダミアンに、アーニャは2つ持っているからと救いの手を差し伸べるが……。／「■■■■の記憶Ⅰ」〈雷（トニト）〉のショックで倒れたロイドは、夢の中で幼少期を思い出す。友達との兵隊ごっこでは〈参謀〉と呼ばれ、平穏な日々を送っていた■■■■だが、突如空爆が街を襲う。

目を覚ますと、空爆によって街は荒れ果て戦場と化していた。そのまま家族と離れ離れになった■■■■は、青年になり軍に入隊。銃を手に戦場に立つ日々だったが、ある夜、オスタニア兵のフランキーと出会い……。

「スキャンダルの裏側」東西交流イベントのため西国（ウェスタリス）に訪問予定だったオペラ界の巨匠・ウェルマンに、不倫や差別発言等のスキャンダルが発覚。さらに劇場へ殺害予告が届き、〈WISE（ワイズ）〉はシルヴィアの指示で対策を練ることに。／「インペリアル・スカラーへの道」ある日の放課後、ヘンダーソンに資料を運ぶ手伝いを頼まれたアーニャ。ヘンダーソンは“皇帝の学徒”（インペリアル・スカラー）に至るための心構えを語るが、アーニャには全く響いていない様子で……。

ヨルは買い物に訪れたデパートで、階段から落ちそうになった女性、メリンダを助けて仲良くなる。驚異的な身体能力を見たメリンダは、ヨルをバレーボールに誘う。その後のお茶会でママ友トークを繰り広げていると、メリンダがダミアンの母であることが判明して……。

「白い嫉妬」バーリント総合病院の診療部部長・ジェラルドは、優秀で人望のあるロイドに立場を奪われたと嫉妬し、あの手この手で嫌がらせをしかけていた。それでも全く評判が落ちない事に腹を立てたジェラルドは、ロイドをスパイだと偽り保安局に通報するが……。／「イーデン校バスジャック事件」社会科見学に行くことになったアーニャ。スクールバスで向かう道中、ダミアンへの「ナカヨシ作戦」に意気込むが、なぜか上手くいかない。そんな中、極左組織〈赤いサーカス〉にバスが乗っ取られてしまい……!?

バスジャックに巻き込まれたイーデン校の面々。周囲が怯える中、アーニャは犯人の心を読んでバスの行き先を突き止める。ベッキーの機転も手伝って、SOSのメッセージを車外に投げ捨てることに成功するが、怪しい動きがバレてアーニャの首に爆弾がつけられてしまい……!?

警察と保安局がバスを包囲し膠着状態が続く中、駆け付けたヘンダーソンが生徒たちに食糧を届けるためバスの中へ。状況を打開するため、アーニャは果敢にテロリストに立ち向かうが……。

事件解決に貢献したことで、〈星（ステラ）〉を授与されたアーニャたち。初めての〈星（ステラ）〉に喜ぶベッキーをよそに、アーニャは調子に乗っているようで……。

「オースティンの苦悩」バスジャック事件以来、不眠症に悩んでいるというセシル寮の寮先生(ルビ：チューター)・オースティンは、ヘンダーソンの紹介でロイドの診察を受けることに。話をする中で、ロイドはオースティンが嘘をついてるのではと訝しむ。どうやら原因は他にあるようで……。／「フツーの飲み会」職場の同僚たちと飲みに行くことになったヨル。同僚にからかわれ、普通はただいまのチューくらいするものだと吹き込まれてしまう。酔って帰宅したヨルは、出迎えてくれたロイドを見てパニックになり……。／「げつめんちゃくりく」東西宇宙開発競争のニュースに感化されロケットの話題で盛り上がるアーニャとユーイン。それを見たダミアンは……。

ヨルが不満を訴えている様子を、偶然家に来たユーリに聞かれてしまったロイド。どうにか場を収めようとするが、〈WISE（ルビ：ワイズ）〉から緊急召集を受け出かけることに。オペレーション〈梟（ルビ：ストリクス）〉を含む〈WISE〉の情報を、内通者のウィーラーが外部に持ち出したことが判明したのだ。ロイドの不倫を疑うユーリは、ヨルと一緒に尾行するが……。

保安局の策略により、正体がバレたロイド。残った足跡から下水道に逃げたと推察したユーリは一人で後を追うが、ユーリに変装した〈黄昏（ルビ：たそがれ）〉と遭遇してしまい、直接対決することに。ロイドは頑丈なユーリに苦戦を強いられて……!?

下水道でウィーラーと遭遇したフィオナ。咄嗟に銃を構えるが、瀕死のロイドを人質に取られ、やむを得ず銃を捨てることに。だが、挑発を受け、怒りのあまりリミッターが外れたフィオナはウィーラーに襲い掛かり……。