「俺たちがついてるんだ、姫は絶対に探し出してやる!」(クーゴ)連れ去られたオーロラ姫の行方を必死に探すクーゴたちは、マグマの星で姫の首飾りを発見する。爆弾が仕掛けられているのも構わず、クーゴは首飾りを取り戻し、姫がこの星で生きていることを確信する。一方、爆発にまぎれてコスモス号を発進させたベラミスは、クーゴたちの目を欺いてデルタ小惑星に向かう。しかしキング・ギューマの差し向けたスペースモンスター・ブラッケンに行く手を阻まれ、絶対絶命の危機に陥ってしまう!
「私は誰にでも逆らう。それが理屈に合わぬことなら」(べラミス)ギューマ軍の追っ手をくらますため、クーゴたちは短距離ワープ航法を繰り返しながら大王星をめざしていた。ベラミスはギララ小惑星へ先回りするが、ギューマ軍のキャプテンゴリオスの闇討ちを受け、キング・ギューマの元へ連行されてしまう。姫を捕らえるのはたやすいと豪語するゴリオス。ベラミスはもしもゴリオスが失敗したらギューマ・ラセツ両軍団のチーフキャプテンの座を自分に与えて欲しいと、キング・ギューマに要求する!
「お前は美しく、そして優しい。しかし、その優しさが命取りになる」(ベラミス)救助信号をキャッチしたコスモス号は発信源のザイクロ星へ向かう。しかし、助けを求める人々の姿はどこにもなかった。実はこれこそ、姫の思いやり深さを利用してクーゴたちから引き離そうというベラミスの作戦だった。出現したモンスター・ドラゴンフライとクーゴたちが戦っている間に、姫が捕まって連れ去られてしまう。大切なギャラクシー・エネルギーが、ラセツ星のために悪用されてしまうのか…。苦悩するジョーゴは、姫を乗せたカプセルに銃口を向ける!
「もう抜け出すことはできない…そこは宇宙の砂漠、地獄の砂漠だ」(ラセツ)ギララ星系の中心に近付いたコスモス号。焦るキング・ギューマは、どんな手を使ってもオーロラ姫を捕らえてクーゴたちを抹殺しろと厳命を下す。命令を受けたベラミスは、ギューマ・ラセツの両軍を率いて総攻撃をしかけてくる。クーゴたちは姫を安全な場所へ逃がそうと試み、罠とも知らず赤い砂漠の惑星に誘い込まれてしまう。クィーン・ラセツは、砂漠に住む無数の植物をモンスター化させ、プラズマ放射によってクーゴたちの命を奪おうと待ち受ける!
「ギューマ・ラセツ軍団、クーゴがいないからって安心するんじゃないぜ」(ジョーゴ)コスモス号がガマギン星に近づいたことを知ったクィーン・ラセツは、モンスター・ガマギンを使って攻撃するよう命令。べラミスは近くにあるラブリー星を巻き込んでしまうと反対するが、ラセツは一蹴する。ラブリー星は戦場となり、オーロラ姫はそこで病に倒れた少年を助ける。少年を救うためには、アイズナー星にある宝石を手に入れなければならない。クーゴはラブリー星を離れてアイズナー星へと急ぐ。それを知ったクィーン・ラセツは、ラブリー星への総攻撃を命令する!
「クーゴめ、ラブリー星での行動は私をだますためのものだったのか!」(ベラミス)ベラミスの不服従に怒るクィーン・ラセツは、特殊部隊のキルメスを利用し、マグネビームで小惑星を消滅させて磁力線の乱気流を引き起こす。アダバ星の基地がコスモス号の姿を捉えるが、味方のはずのキルメスの攻撃を受けて全滅。救助に向かったクーゴたちは外人部隊の少女・シルスの亡骸を発見し、その無残な仕打ちに憤る。クィーン・ラセツから部隊を全滅させたのはクーゴだと思い込まされたベラミスは、クーゴに一対一の決闘を申し込む!
「君は素敵なライバルだぜ。強くてかっこよくておまけに美人だ」(クーゴ)コスモス号はギューマ星とラセツ星に迫っていた。業を煮やしたキング・ギューマは、もはや部下には任せておけないと自らが出撃することを決意する。先手を打って出たクーゴたちは、ギューマ軍の前線基地を発見してこれを破壊。ベラミスは小惑星へ逃れたコスモス号をおびき出すため、反物質爆弾を仕掛ける。ところがその星には、避難民たちの宇宙船が不時着していた。クーゴとベラミスは戦いを一時中断し、爆発によって瓦礫に埋まった宇宙船を救い出そうとするが…。
「わしはギララ星系の、いや全宇宙の支配者キング・ギューマだ」(ギューマ)コスモス号はキング・ギューマの手によって挟み撃ちにされ、ワープして逃げようと試みるものの、スペースウォールに跳ね返されて動けなくなってしまう。クーゴたちと対面したキング・ギューマは、姫を渡して降参しろと要求。断るクーゴたちめがけ、ギューマ軍はソニックブラスターを発射する。間一髪でコスモス号を逃がしたのは、キング・ギューマに姫を奪われることを恐れたラセツだった。必死で逃げるコスモス号に、クィーン・ラセツはしたたかに魔の手を伸ばす!
「無茶っていうのはクーゴさんから教えられたことのひとつです」(オーロラ)ついにキング・ギューマが全艦隊を率い、コスモス号に総攻撃を開始した。クーゴたちはオーロラ姫を守るため、心をひとつに合わせて迎え撃つが、圧倒的な数に押されて次第に苦境に追い込まれてゆく。このままではクーゴたちの命が危ない。オーロラ姫は自分の命と引きかえに攻撃をやめるようにキング・ギューマに要求。それを知ったクーゴは、敵の目をごまかすために姫をレフトフライ星に隠すが、そこにはベラミスが待ち構えていた。姫はベラミスの手によって、ラセツ星へと連行されてしまう!
「私はまた故郷の星を失ってしまった」(ベラミス)ついにオーロラ姫を手中に収めたクィーン・ラセツは、ギャラクシー・エネルギーを独り占めしようと、姫の体をスーパーコンピューターの一部としてセットする。その瞬間、ラセツの裏切りを知ったギューマ軍団が攻め込んでくる。両軍入り乱れての戦いとなり、スペースウォールが崩壊。クーゴはその隙に乗じてオーロラ姫を救い出すことに成功するが、怒ったラセツが仁王ロボを差し向けてくる。アストロ棒も通じない強敵に、クーゴは一体どう戦うのか!?
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