ひょんなことからアンゴラモンと気まずい空気になってしまい、街を一人歩きしていた瑠璃。夜の竹林公園で、瑠璃はカマイタチの原因であるレッパモンと出会う。
知り合いの教授から届いた不幸の手紙の様な怪しいメールを消去した清司郎。すると突如、ゲームの中から大量のザッソーモンが現れる!
街のデジモンたちが、突如飛来するナイフによって殺されるという事件が頻発。宙たちとクロックモンが事件を調べる事になるのだが…。
清司郎が参加する学会に付き添い、とあるリゾート地へやって来た宙たち。ボコモンのことを引きずり元気のないガンマモンを、宙は何とか元気づけたいと考えていた。
どんな悩みも100%解決するが、いつ、どこに現れるか判らない謎の占いの館、その名はメフィスト。瑠璃は親友のミカに頼まれ、その占いの館を探すことになった。
ガンマモンを連れ趣味のソロキャンプに来た宙は、キャンプ場の管理人から「最近、神隠しのように帰ってしまうお客さんがいる」という不思議な話を聞くのだが…
豪雪地帯の地熱発電所にメンテナンスの依頼を受けてやってきた清司郎と、彼についてきた宙たち。そのシステムは、かつて清司郎が開発に携わったものだった。
ある朝、部屋にホークモンが訪ねて来て「人間の友達を探してほしい」とお願いされる宙。宙の代わりに、失踪した子の住む家に調査に向かった清司郎とジェリーモンだったが…。
ある日の夕方、ガンマモンをはじめてのおつかいに送り出した宙。心配しながら後を尾けていると宙の耳におかしな声が聞こえ始め、その場から姿が消えてしまう。
宙とガンマモンたちが遊園地を楽しんでいると、突如としてダークリザモンたちが現れた。そこで、宙にブラックテイルモンの居場所を尋ねるダークリザモンたちは…。
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