パリで起こる怪事件。なんと、颯也たちは全身から植物の生えた人間を発見した。次の被害者はルナだった。ルナは全身から不気味なキノコを生やして意識を失う。
ファントム・ローリエの食材にされてしまった逃走者たち。このままではローリエに調理され、最後には食べられてしまうだろう。
デュポンと共にジェレミーの計画を追っているホワイトハッカーが「マ」と言う言葉を遺し、新たなファントム、ファントム・クロウに殺害された。
ミッションは、「ファントム計画を阻止するため、ジェレミーの居場所を特定し、捕まえろ」。だが、デュポンの協力者が残した「マ」で始まる場所にジェレミーはいなかった。
ミッションを失敗してしまった颯也たちに、40体のハンターが襲いかかる。ジェレミーの目的は、ハルの脳内データをスーパーコンピューターにコピーすることだった。
ファントム・エルキュールの電撃トルネードで吹き飛ばされた颯也。壁に激突!?と思われたが、それを救ったのはモーリスだった。
最終ミッションをクリアし、ジェレミー博士の陰謀を打ち砕いた逃走者たち。しかし、スーパーコンピューターから抜け出たAIが意思を持ち、颯也たちの前に現れた!
全てのミッションが終了し、残された時間はあと僅か。皆が息を飲んで見守る中、勝ち残った颯也、モーリス、ハル、ルナの最後の逃走が始まった。
ついに開幕したムーンワールドコロニーチャンピオンシップ。まずは予選。これに勝ち残らなければ決勝へは進めない。颯也たちは予選のステージへ向かい、、、
歴史を守るため、フジミトラベラーズを追う颯也たち。連中が持つ「気象データ」を破り捨てないと、第二次大戦の結果が変わってしまうかもしれなく、、、
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