地球を癒やし“お手当て”してきた秘密の世界【ヒーリングガーデン】が、地球をむしばみ 病気にしようとする【ビョーゲンズ】の襲撃にあって危機に陥ったため、地球が大ピンチに！このピンチを救うため、逃げのびた３人の“地球のお医者さん見習い”であるヒーリングアニマルたちが、“ヒーリングガーデンの王女”で【特別なちから】を持ったラテとともに、パートナーを探しにやって来た！3人の普通の女の子が彼らと出会うことでプリキュアに変身し、ビョーゲンズに立ち向かう！
わたしは花寺のどか。今日は楽しい土曜日♪ちゆちゃんとひなたちゃんと宿題をしたあとにお花見！のはずだったんだけど・・・。大変！そこへ突然、謎の敵・リフレインに追われて困っている精霊ミラクルンがあらわれたの！わたし、ミラクルンを助けたい！「スタートゥインクルプリキュア」と「HUGっとプリキュア」のみんなも駆けつけて、なにんとかピンチを脱出！と思ったら、ふわあ～！？時間が戻されて今日がまたはじまっちゃった！？「今日」から抜け出すカギはミラクルンライト！ミラクルンを助けるため！そして「明日」へ行くために！わたしたちはあきらめない！！みんなで明日に飛び出そう！
