京都豊島区にある木造アパート「トキワ荘」。そこには“漫画の神様”手塚治虫（北村想）が住み、日夜、編集者たちが彼のもとに通いつめていた。向かいの部屋に住む寺田ヒロオ（本木雅弘）は、その様子を眺めながら、こつこつと出版社への持ち込みを続けていた。やがてトキワ荘を去った手塚治虫と入れ替わるように、若き漫画家の卵たちが次々に入居してくる。藤本弘／藤子・F・不二雄（阿部サダヲ）、安孫子素雄／藤子不二雄Ⓐ（鈴木卓爾）、石森章太郎（さとうこうじ）、赤塚不二夫（大森嘉之）、森安直哉（古田新太）、鈴木伸一（生瀬勝久）。また近所に住むつのだじろう（翁華栄）もトキワ荘に入り浸っていた。揃って『漫画少年』の投稿仲間だった彼らは、寺田を中心に“新漫画党”を結成。貧しい生活のなか、互いを励ましあい、漫画の未来について熱く語り合う日々が続く。なかでも一番年上の寺田は兄貴分的存在として若き彼らを静かに見守り、その視線は、赤塚の友人であり自分とはまったく異なる作風のつげ義春（土屋良太）にも向けられていた。そんなある日、『漫画少年』の出版社、学童社が突如倒産。これを機に、８人の仲間たちの進む道も少しずつ変化していく。どんどん売れっ子になっていく者。漫画からアニメーションへの移行を決意する者。なかには東京を去る者もいた。流行に惑わされず、黙々と自分の描きたい漫画だけを追い求めているように見えた寺田の心にも、徐々に迷いが生まれてくる。時代の激しい変化とともに、漫画家の卵たちの青春の日々にも、ゆっくりと終わりの気配が近づいていた――。
（パート1）古ぼけた区民館の一室。ここは劇団かもめ座の稽古場。なかなか芽のでない“女優”日高雪子（紀那きりこ）がやってくる。面接を経て入団するも、古参俳優の晋（白畑真逸）のひと言で劇団は崩壊の危機に。まとめ役のりえ（倉多七与）は新たな仲間を募るが、身勝手な俳優たちの言動に雪子は巻き込まれ翻弄されていく。そして新旧の対立が勃発して・・・。（パート2）劇団に残った雪子と良重（岩松れい子）は、かもめ座を再生させるため次回公演をチェーホフ作『ワーニャ伯父さん』と決める。キャストが集まり稽古が始まるが、年少のそら（平井友稀奈）の自己主張の強さに雪子は困惑。出戻りメンバーの哲夫（小山鉄平）と智之（司馬正太郎）からのプライベートなアプローチにも悩まされ、雪子は劇団運営の難しさに直面していく・・・。
