民衆を煽り幕府への謀反を企む怪しげな新興宗教・白蓮教を調査していた狐の集団の当主・石動律花（山本千尋）。そこで律花は、将軍からの任務を受けて現れた風魔忍者のお喬（宮原華音）と出会う。 律花とお喬たちが立ち向かうべき敵は同じ、徳川家に恨みを持ち復興を願う、服部半蔵（ケイン・コスギ）率いる伊賀忍者たちであった！！その背後には幕府に復讐を誓うある人物の哀しい過去があって・・・。BLACKFOXの世界とSHOGUN’S NINJAの世界が交わる。狐の集団 VS 風魔忍者 VS 伊賀忍者の忍者大戦＝NINJA WARSが幕を開ける！！
海外向けYouTubeチャンネル「24／7 SAMURAI － SHINOBI」で2,100万回超の視聴実績を誇る『BLACKFOX： Age of the Ninja』と、配信開始直後に115万回再生を記録した『SHOGUN’S NINJA-将軍乃忍者-』の世界観が融合！メガホンを取るのは、「ウルトラマン」「仮面ライダー」「スーパー戦隊」シリーズ全てでメイン監督を務めた、坂本浩一。『今際の国のアリス』など数々の話題作に出演し、『BLACKFOX： Age of the Ninja』でも主演を務めた山本千尋を今作の主演に迎え、『SHOGUN’S NINJA-将軍乃忍者-』でW主演を務め圧倒的な結果を残した宮原華音、モデルや俳優として幅広く活動する桃月なしこ、国際的なアクションスター、ケイン・コスギたちが共演！！日本トップレベルのアクション満載の“NINJAユニバース作品”が誕生する。
